Captain Tsubasa Sub Indo – Kapten Tsubasa adalah kisah penuh gairah tentang seorang siswa sekolah dasar yang pemikiran dan impiannya hampir seluruhnya berkisar pada kecintaan terhadap sepak bola. Tsubasa Oozora yang berusia 11 tahun mulai bermain sepak bola pada usia yang sangat muda, dan meskipun itu hanya sekedar olahraga rekreasi untuk teman-temannya, baginya, itu berkembang menjadi semacam obsesi.
Untuk mengejar mimpinya dengan kemampuan terbaiknya di sekolah dasar, Tsubasa pindah bersama ibunya ke kota Nankatsu, yang terkenal dengan tim sepak bola sekolah dasar yang unggul. Namun meskipun ia bisa dengan mudah menjadi yang terbaik di kota lamanya, Nankatsu memiliki lebih banyak kompetisi, dan ia akan membutuhkan seluruh keterampilan dan bakatnya agar dapat menonjol dari kelompok baru ini.
Dia tidak hanya bertemu rival, tapi juga teman baru seperti gadis cantik Sanae Nakazawa dan kiper berbakat, Genzo Wakabayashi, yang memiliki semangat yang sama dengan Tsubasa, dan akan terbukti menjadi teman berharga dalam membantunya mencapai impiannya. Mewakili Jepang di Piala Dunia FIFA adalah impian utama Tsubasa, namun dibutuhkan lebih dari sekedar bakat untuk mencapainya.